Jednolite studia magisterskie dla kandydatów na oficerów na kierunku studiów Nawigacja trwają dziesięć semestrów i umożliwiają nabycie wiedzy teoretycznej oraz praktycznej związanej, przede wszystkim, z przyszłą służbą na stanowisku oficerskim w działach pokładowych na okrętach Marynarki Wojennej (specjalność Eksploatacja okrętowych systemów pokładowych), jak również w jednostkach brzegowych Marynarki Wojennej (specjalność Eksploatacja morskich systemów uzbrojenia oraz Eksploatacja morskich systemów bezzałogowych).

Koncepcja kształcenia zakłada, że absolwent kierunku studiów Nawigacja nabędzie kompleksową, poszerzoną wiedzę i umiejętności z zakresu nawigacji, zwłaszcza nawigacji morskiej oraz uzyska w trakcie trwania studiów bardzo dobre przygotowanie teoretyczne, a także zdobędzie umiejętności praktyczne niezbędne w przyszłej pracy nawigatora. Program studiów na kierunku nawigacja na jednolitych studiach magisterskich spełnia wymagania zawarte w Rozporządzeniu Ministra Infrastruktury i Rozwoju w sprawie ramowych programów szkoleń i wymagań egzaminacyjnych dla marynarzy działu pokładowego (t.j. Dz.U. 2023 poz. 1566). Zgodnie z wymienionym Rozporządzeniem, program studiów oparty jest na ramowym programie szkolenia dla marynarzy działu pokładowego (stanowiącym Załącznik nr 3 do wymienionego Rozporządzenia). Program obejmuje zagadnienia realizowane na poziomie operacyjnym w żegludze międzynarodowej, w związku z czym absolwent, po zdaniu egzaminu dyplomowego uznanego za równoważny z egzaminem kwalifikacyjnym na poziomie operacyjnym zgodnie z Rozporządzeniem Ministra Gospodarki Morskiej i Żeglugi Śródlądowej z dnia 4 lutego 2016 r. w sprawie uznania egzaminu dyplomowego w uznanych uczelniach za równoważny z egzaminem kwalifikacyjnym na poziomie operacyjnym (Dz. U. 2016 poz. 220) oraz po odbyciu praktyki pływania określonej Rozporządzeniem Ministra Gospodarki Morskiej i Żeglugi Śródlądowej z dnia 23 kwietnia 2018 r. w sprawie wyszkolenia i kwalifikacji członków załóg statków morskich (Dz. U. 2023 poz. 1383 z późn. zm.) zdobędzie uprawnienia do uzyskania dyplomu oficera wachtowego w dziale pokładowym w żegludze międzynarodowej.

Umiejętności praktyczne rozwijane w trakcie studiów umożliwią absolwentowi prowadzenie nawigacji morskiej z wykorzystaniem nowoczesnych systemów i urządzeń pomiarowych; począwszy od ich przygotowania, w tym uwzględnienia ich ograniczeń, poprzez bieżącą kontrolę pomiarów, skończywszy na wstępnym opracowaniu wyników zgodnie z obowiązującymi standardami międzynarodowymi. Praktyczny wymiar dużej części zajęć przygotuje absolwentów do samodzielnej i zespołowej pracy zawodowej.

Absolwent jednolitych studiów magisterskich na kierunku Nawigacja posiadać będzie umiejętność posługiwania się wiedzą z zakresu nawigacji: obiektów, środków transportu i komunikacji. Posiadać będzie biegłość w zakresie określania pozycji oraz wyboru właściwej trajektorii w celu zapewnienia bezpieczeństwa ruchu zarówno w złożonych sytuacjach środowiskowych, jak i zagrożenia kolizją. Absolwent jednolitych studiów magisterskich na kierunku Nawigacja przygotowany będzie do pracy na morzu z uwzględnieniem zasad bezpieczeństwa ludzi, obiektów i środowiska w kontekście uwarunkowań technicznych i prawnych oraz racjonalnej eksploatacji urządzeń i systemów

Po zdaniu egzaminu oficerskiego, obronie pracy magisterskiej i zdaniu egzaminu dyplomowego absolwenci otrzymują tytuł magistra inżyniera oraz stopień podporucznika i są wyznaczani na stanowiska służbowe w Siłach Zbrojnych RP. Absolwent jednolitych studiów magisterskich otrzymuje tytuł magistra inżyniera, dyplom ukończenia jednolitych studiów magisterskich oraz prawo do kwalifikacji na studia III stopnia oraz studia podyplomowe.